Левобережные притоки - Кас (200 км), Сым (507 км), Елогуй (560 км), Турухан (703 км) - сравнительно небольшие реки, которые берут свое начало на плоских заболоченных водоразделах и медленно текут по широким долинам восточной части Западно-Сибирской низменности. Ихтиофауна представлена почти исключительно частиковыми - щукой, плотвой, окунем, язем и ельцом.

Правобережные притоки - Подкаменная и Нижняя Тунгуски, Ангара, Курейка (835 км) - имеют горный и полугорный характер и протекают в узких и глубоких долинах Средне-Сибирского плоскогорья. Течение их изменчиво. По осадочным породам, широким долинам реки текут спокойно, плавно, в местах сужения долины русло становится порожистым, течение бурным. В ихтиофауне преобладают хариус, ленок, тугун, щука, окунь, елец и налим. Встречаются осетр и стерлядь.